該博物館是一座以展示發揚民族文化為主，兼具收藏、展示、研究、閱覽、教育、宣傳《蒙古秘史》為主的綜合性公益性文化場所。總使用面積6220平方米，由序廳、中央可汗廳、曲雕廳、書海廳、納忽廳、斡難廳6個展廳和伊金廣場組成，共展示各類文物、藝術品、書籍等2676件。

        伊金廣場上，以書法長卷為模版，采用拓版工序，鑿刻空心字，將《蒙古秘史》全文6萬余字刻在漢白玉石板上，形成蔚為壯觀的場景。

        該漢白玉石所刻《蒙古秘史》正面為蒙古文，碑陰為漢文，均以金箔貼飾，白底金字，分外耀眼。

        作為一家以世界名著《蒙古秘史》為主題的博物館，鄂托克旗蒙古秘史博物館系統展示了《蒙古秘史》原始資料、相關文獻資料，珍藏了成吉思汗金幣、元代畫押、八思巴文銅錢等重要文物211件，陳列了由中蒙30多位畫家繪制的《蒙古秘史》系列油畫作品和13種《蒙古秘史》系列藝術品，開拓了在世界范圍內把一部典籍用多種載體、多種工藝藝術再現的先河。

        鄂托克旗蒙古秘史博物館創始人包金山先生用回鶻式蒙古文書寫的《蒙古秘史》書法長卷，也被內蒙古自治區人民政府作為內蒙古自治區的唯一禮物，獻給上海世界博覽會。

        此外，該館陳列的駝骨骨雕《蒙古秘史》，以690根駝骨為物化材質，將《蒙古秘史》的全文282節的全部內容雕刻于駱駝的小腿骨上，且采用陰刻手法，上下都用300克的銀子鑲嵌裝飾;瓷柱以景德鎮青花瓷為物化材質，采用陽刻的手法將《蒙古秘史》全文燒制于瓷柱上。瓷柱高220厘米，直徑60厘米，底座采用進口黑檀木雕刻而成。這樣的瓷柱共有66根，是為了紀念成吉思汗享年66歲。

        《蒙古秘史》是蒙古族第一部書面著作，它記載了一代天驕成吉思汗的先祖譜系和他本人一生的業績，同時也記載了太宗窩闊臺汗統治時代的歷史。這部罕見的史冊，生動地描繪了古代蒙古社會生產活動、組織機構、氏族變遷、部落戰爭、社會心理、民間習俗等諸多方面，又使其成為古代蒙古社會歷史的百科全書。

《電鰻快報》